El desarrollador principal de Assassin's Creed Shadows asegura a los jugadores que elegir un solo protagonista no afectará significativamente su experiencia. El juego presenta dos personajes jugables: Naoe, una femenina shinobi, y Yasuke, un samurai africano histórico, cuya inclusión ha generado el zumbido previo al lanzamiento.
Surgieron preocupaciones de que centrarse en un personaje podría conducir a elementos de la historia perdidos o un juego. El director creativo Jonathan Dumont abordó estas preocupaciones, describiendo su propio enfoque equilibrado: cambia entre Naoe y Yasuke, jugando varias horas con una antes de cambiar a la otra.
Sin embargo, Dumont enfatiza que los jugadores no serán desfavorecidos significativamente al favorecer a un personaje. Si bien cada protagonista cuenta con secuencias de apertura únicas y historias personales, la narrativa central se adapta a la elección del jugador. Él alienta a los jugadores a priorizar su personaje preferido: "La experiencia central es flexible. Elige tu favorito; la narración se adaptará". Esencialmente, aunque existen arcos de personajes individuales, la historia general sigue siendo accesible, independientemente de qué protagonista se juegue principalmente.